Минфин РФ в своем письме № 03-11-06/2/89 от 07.06.2010 уточняет особенности применения УСН и системы налогообложения в виде ЕНВД, в случае если организация как комиссионер ведет деятельность по оптовой реализации хлебобулочных изделий, а также розничную реализацию продукции со своего автотранспорта.
В письме отмечается, что предпринимательская деятельность организации, являющейся комиссионером и осуществляющей розничную торговлю комиссионными товарами через собственный объект нестационарной торговой сети, подлежит переводу на уплату ЕНВД.
При этом налогоплательщики, осуществляющие наряду с предпринимательской деятельностью, подлежащей налогообложению единым налогом, иные виды предпринимательской деятельности, исчисляют и уплачивают налоги и сборы в отношении данных видов деятельности в соответствии с иными режимами налогообложения, предусмотренными Кодексом.
Исходя из этого, а также учитывая понятие договора комиссии, у комиссионера, применяющего УСН по видам деятельности, по которым он не переведен на уплату ЕНВД, в составе доходов при определении объекта налогообложения по налогу, уплачиваемому в связи с применением УСН, учитывается только комиссионное вознаграждение, относящееся к деятельности в сфере оптовой торговли.