Да, можно.
Однако это правило действует при выполнении следующих условий.
Во-первых, должны быть соблюдены стоимостные и количественные показатели, ограничивающие право применения упрощенки (п. 2 ст. 346.12 НК РФ).
Во-вторых, обособленное подразделение не должно быть указано в учредительных документах фирмы в качестве филиала или представительства. Это связано с тем, что Налоговый кодекс РФ запрещает применять упрощенку фирмам, имеющим структурные подразделения с таким статусом (подп. 1 п. 3 ст. 346.12 НК РФ). Понятие «обособленное подразделение» шире понятий «филиалы» и «представительства» (ст. 11 НК РФ, ст. 55 ГК РФ). Поэтому фирма может применять упрощенку, если ее обособленное подразделение не имеет статуса филиала или представительства.
Аналогичная точка зрения отражена в письмах Минфина России от 23 января 2006 г. № 03-01-10/1-14, УФНС России по г. Москве от 19 августа 2005 г. № 18-11/3/59174.
При нарушении хотя бы одного из этих условий фирма не вправе применять упрощенную систему налообложения.