ООО на УСН существует чуть меньше 1 года.
При выставлении счета была допущена ошибка и счет был выставлен на n-сумму, и снизу было написано в том числе с НДС.
В итоге по двум счетам на ООО пришли деньги. Счета выставлены в том числе с НДС
Первый счет на покупку строительных  материалов, деньги поступили от Муниципального образования района.
Второй счет на оказание услуг, деньги поступили от администрации района.
Денежные переводы прошли в конце мая.

Как поступить в данной ситуации? Какие могут быть последствия?

В будующем ООО планирует переходить с УСН на ОСНО.